コイ科

Family Acheilognathidae Bleeker, 1863
Family Balitoridae Swainson, 1839
Family Catostomidae Agassiz, 1850
Family Cobitidae Swainson, 1838／ドジョウ科
Family Cyprinidae Rafinesque, 1815／コイ科
Family Danionidae Bleeker, 1863
Family Gobionidae Bleeker, 1863
Family Nemacheilidae Regan, 1911
Family Tincidae Jordan, 1878
Family Xenocyprididae Günther, 1868

Abraminae／アブラミス亜科／ハクレン属、コクレン属
Acheilognathinae Bleeker, 1863／タナゴ亜科／タナゴ属
Barbinae Bleeker, 1859／バルブス亜科／タモロコ属
Cyprininae／コイ亜科／コイ属、フナ属
Gobioninae／カマツカ亜科／カマツカ属、ツチフキ属、ゼゼラ属、スゴモロコ属、ニゴイ属、モツゴ属
Leuciscinae Bonaparte, 1835／ウグイ亜科／ウグイ属、ヒメハヤ属